DNA-Taxonomie als Werkzeug in der
Biodiversitätsforschung; Erfassung, Bewertung, Monitoring und Nutzung der genetischen
Vielfalt eukaryontischer Syteme (Zoologische Staatssammlung München mit Universität
Bremen [Teilvorhaben MOLART])
1. Gesamtziel des Vorhabens
Die DNA-Taxonomie ermöglicht nicht nur eine schnelle Identifikation
bekannter Arten, sie hilft auch die genetische Diversität taxonomisch problematischer
Lebensgemeinschaften mit einem vernünftigen Zeit- und Arbeitsaufwand zu ermitteln. Das
primäre Ziel des Projekts ist, ein taxonomisches System auf DNA Ebene zu etablieren, das
für ein breites Spektrum an Insektenarten (später auch andere Tiergruppen) anzuwenden
ist und Taxonomen leicht zugänglich ist. Es soll hierzu ein zoologisches
DNA-Dateninformationssystems entwickelt werden, also ein Programm, das große Mengen an
Sequenzdaten verwalten kann, sowie eine Insekten-spezifische DNA-Datenbank generiert
werden. Das Programm und die Datenbank sollen einem breiten Anwenderkreis zugänglich
gemacht werden (z.B. über das WorldWideWeb). Innerhalb des Insektenverbundprojekts EDIS
soll das zoologische DNA-Informationssystem über die Plattform SysTax (Dr. Hoppe, Ulm)
mit weiteren Datenbank-Modulen verbunden werden, um so die Integration von molekularen,
morphologischen, ökologischen und geographischen Daten zu ermöglichen. Das Teilvorhaben
MOLART stellt zusätzlich noch eine Sammlungsdatenbank der Collembolen Skandinaviens
online zur Verfügung und sorgt für die Anbindung weiterer Collembolen-Datenbanken.
2. Wissenschaftliches Arbeitsprogramm
- Entwicklung der zoologischen DNA-Taxonomie-Datenbank (Z-ARB) durch Anpassung der
Datenbank ARB und Anbindung an die Plattform SysTax;
- Aufnahme von verwertbaren Sequenzinformationen aus öffentlichen DNA-Datenbanken (EMBL,
Genebank) in Z-ARB;
- Aufbau eines molekularbiologischen Labors an der Zoologischen Staatssammlung München
(ZSM) und Optimierung der molekularbiologischen Methodik auf hohen Probendurchsatz;
- Experimentelle Testphase: Suche nach geeigneten Gensequenzen und Überprüfung deren
Auflösungsvermögen in den verschiedenen Insektentaxa;
- Einsatz der "Signalsequenzen" als Werkzeug in der angewandten Taxonomie und
Biodiversitätsforschung;
- Eingabe der erstellten Sequenzdaten in die Datenbank Z-ARB;
- Integration der DNA-Taxonomie in die systematische Grundlagenforschung durch Klärung
taxonomischer Problemfälle mittels DNA-Typisierung. Dabei werden bestimmte problematische
Taxa ausgewählt und in enger Kooperation mit den jeweiligen Spezialisten bearbeitet;
- Etablierung von DNA-Typussammlungen an der Zoologischen Staatssammlung München;
- Anwendung, Vergleich und kritische Überprüfung (hierarchische Herangehensweise,
Aufwandsanalyse, Aussagekraft auf unterschiedlichen Klassifikationsniveaus) verschiedener
molekularbiologischer und klassisch-morphologischer Klassifikationsmethoden am Beispiel
zweier ausgewählter Collembolen-Taxa;
- Optimierung molekularer Klassifikationstechniken für Collembolen;
- Übertragung der Ergebnisse von (j) auf andere Insektentaxa;
- Revision der Collembolen Skandinaviens;
(i-l: Teilvorhaben MOLART, zusätzlich Beiträge zu b, d, g und h).
3. Leistungen und Produkte des Teilprojektes
- Bereitstellung eines im Internet verfügbaren DNA-Datenbankmoduls mit Sequenzinformation
von sicher determinierten Arten, das überinstitutionell anwendbar und in das
Insekten-Informationssystem EDIS eingebunden ist;
- Bereitstellung eines online-verfügbaren genetischen Identifikationssystems, das die
zuverlässige und schnelle Zuordnung von Organismen anhand ihrer DNA-Sequenz zu
determiniertem Museumsmaterial ermöglicht;
- Bereitstellung von DNA-"Typus"-Sammlungen;
- Bereitstellung der Datenbank "Collembola of Fennoscandia and Denmark"
(Sammlung Fjellberg, mit Verbreitungsangaben) im Internet; Anbindung an andere
Collembolen-Datenbanken;
- Bestimmungsbuch "Collembola of Fennoscandia and Denmark. Part 2: Entomobryomorpha
and Symphypleona";
(d-e: Teilvorhaben MOLART, zusätzlich Beiträge zu b und c). |